گرچه فیلیپین یک مجمعالجزایر است اما اغلب بازدیدکنندگان با هواپیما به اینجا میرسند. فرودگاههای بین المللی فیلیپین در سیبو، منطقهی بندر آزاد کلارک، آنگلس (Angeles)، داوائو، کالیبو، لائواگ (Laoag)، مانیل و زامبوانگا واقع شدهاند.
فرودگاه مناسبتر، فرودگاه بین المللی ماکتان - سیبو یا فرودگاه بین المللی کالیبو است که هم در مرکز مجمعالجزایر فیلیپین و هم خارج از منطقه توفانهای دریایی واقع شده است.